Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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