Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms