Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms