Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms