Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf128Q9D304 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms