Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx20Q9D2Y5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms