Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Trappc6bQ9D289 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Trappc6bQ9D289 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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