Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms