Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hddc3Q9D114 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hddc3Q9D114 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hddc3Q9D114 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hddc3Q9D114 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hddc3Q9D114 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hddc3Q9D114 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hddc3Q9D114 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Hddc3Q9D114 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hddc3Q9D114 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms