Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nip7Q9CXK8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms