Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Xrcc3Q9CXE6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Xrcc3Q9CXE6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc3Q9CXE6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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