Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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