Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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RpainQ9CWY9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RpainQ9CWY9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RpainQ9CWY9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RpainQ9CWY9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RpainQ9CWY9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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