Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkrip1Q9CWV6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms