Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ctnnbl1Q9CWL8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms