Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms