Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV4

Retreg3, Reticulophagy regulator 3, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg3Q9CQV4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retreg3Q9CQV4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retreg3Q9CQV4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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