Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms