Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms