Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp2Q9CQ73 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms