Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms