Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms