Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn6Q99PL6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn6Q99PL6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms