Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pbx4Q99NE9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pbx4Q99NE9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pbx4Q99NE9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pbx4Q99NE9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx4Q99NE9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms