Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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