Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms