Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc12a9Q99MR3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc12a9Q99MR3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc12a9Q99MR3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc12a9Q99MR3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc12a9Q99MR3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc12a9Q99MR3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc12a9Q99MR3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc12a9Q99MR3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc12a9Q99MR3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc12a9Q99MR3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms