Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst12Q99LL3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms