Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Sh3bp5lQ99LH9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Sh3bp5lQ99LH9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Sh3bp5lQ99LH9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Sh3bp5lQ99LH9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Sh3bp5lQ99LH9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Sh3bp5lQ99LH9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp5lQ99LH9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp5lQ99LH9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp5lQ99LH9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp5lQ99LH9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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