Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp16Q99LG0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms