Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms