Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms