Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Dnajb11Q99KV1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dnajb11Q99KV1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Dnajb11Q99KV1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Dnajb11Q99KV1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Dnajb11Q99KV1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Dnajb11Q99KV1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Dnajb11Q99KV1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Dnajb11Q99KV1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Dnajb11Q99KV1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Dnajb11Q99KV1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Dnajb11Q99KV1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dnajb11Q99KV1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms