Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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