Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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