Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms