Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Afg3l1Q920A7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Afg3l1Q920A7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Afg3l1Q920A7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Afg3l1Q920A7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Afg3l1Q920A7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms