Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf6Q91YR7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms