Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms