Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col26a1Q91VF6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms