Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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