Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Uhrf1Q8VDF2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Uhrf1Q8VDF2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Uhrf1Q8VDF2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Uhrf1Q8VDF2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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