Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VCE4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VCE4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms