Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms