Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms