Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms