Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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