Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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