Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casc3Q8K3W3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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