Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms